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随着金融业改革的深化，新的《企业会计制度》、《金融企业会计制度》等法规相继出台，商业银行的会计处理方法有了很多变化。根据《金融企业会计制度》的规定，票据贴现业务的会计处理就是其中的变化之一，它对商业银行确认损益有相当的影响。
新《金融企业会计制度》实施之前，按照1993年《金融保险企业财务制度》规定，商业银行对票据贴现业务一直遵循收付实现制的原则，即“贴现发放款按贴现票据的面值计价，利息和手续费部分计入当期损益”。2000年财政部发布《关于印发〈公开发行证券的商业银行有关业务会计处理补充规定〉的通知》中，进一步明确“贴现票据的到期价值与支付的票据贴现款项之间的差额，作为贴现利息，计入贴现当期损益”。这样规定有一定的业务发展背景：首先，在我国无论是商业承兑汇票，还是银行承兑汇票，期限都限在6个月以内，跨度较短；其次，票据贴现业务基本上都是贴息式，即贴现用票据面值扣减贴现日至到期日的利息后，余值付给原票据持有人。
贴现息在贴现业务发生时就实际收到，所以计入当期损益使会计处理比较简单；再次，由于银行票据贴现业务原来开展得并不普遍，在银行收益中只占很少一部分，即使按照收付实现制体现收支，从重要性原则来讲，也不会损害会计报告整体的公允性。
根据2002年以前的相关规定，一笔票据贴现业务，主要会计处理仅在贴现日和票据款项收回时反映。例如：2002年11月1日，某企业以面值100万元的票据进行贴现，贴现息为月利率2‰，贴现期6个月，则银行的会计处理应为：贴现利息＝1000000×2‰×6＝12000（元）。2002年11月1日会计处理为：
借：贴现——××户 1000000
贷：活期存款——××户 988000
利息收入——贴现利息收入－××户 12000
借：递延收益——待实现贴现利息收入－××户 4000
贷：利息收入——贴现利息收入－××户 4000
与原制度下的会计处理方法相比，对于这笔贴现业务，银行本年减少了利息收入12000－4000＝8000（万元）。
2003年第一季度末，银行应作如下会计处理：
借：递延收益——待实现贴现利息收入－××户 6000
贷：利息收入——贴现利息收入－××户 6000
2003年5月1日收回票据款项时，再确认4月份应计收入：
借：存放中央银行款项 1000000
贷：贴现——××户 1000000
借：递延收益——待实现贴现利息收入－××户 2000
贷：利息收入——贴现利息收入－××户 2000
这样，对于持有跨期票据的银行，根据新制度规定，会减少本期收入，推迟到以后会计期间反映。由于新的会计处理方法更能反映资金占用、相应风险与收入的配比关系，从而使企业的财务状况核算更加科学。
2002年5月1日收回贴现票据款时：
借：存放中央银行款项 1000000
贷：贴现——××户 1000000
近两年，票据贴现已经成为商业银行一项重要的资产业务，为了更真实地反映商业银行的财务状况，新的《金融企业会计制度》明确了对票据贴现业务也应遵循权责发生制原则：“金融企业的会计核算应当以权责发生制为基础。凡是当期已经实现的收入和已经发生或应当负担的费用，不论款项是否收付，都应当作为当期的收入和费用；凡是不属于当期的收入和费用，即使款项已在当期收付，也不应当作为当期的收入和费用”。所以在新制度下，票据贴现业务的相关会计处理应做如下变动：
2002年11月1日贴现业务发生时：
借：贴现——××户 1000000
贷：活期存款——××户 988000
递延收益——待实现贴现利息收入－××户 12000
2002年12月20日结息时，应计入当期损益的为11月、12月两个月的利息收入： 借：递延收益——待实现贴现利息收入－××户 4000
贷：利息收入——贴现利息收入－××户 4000
与原制度下的会计处理方法相比，对于这笔贴现业务，银行本年减少了利息收入12000－4000＝8000（万元）。
2003年第一季度末，银行应作如下会计处理：
借：递延收益——待实现贴现利息收入－××户 6000
贷：利息收入——贴现利息收入－××户 6000
2003年5月1日收回票据款项时，再确认4月份应计收入：
借：存放中央银行款项 1000000
贷：贴现——××户 1000000
借：递延收益——待实现贴现利息收入－××户 2000
贷：利息收入——贴现利息收入－××户 2000
这样，对于持有跨期票据的银行，根据新制度规定，会减少本期收入，推迟到以后会计期间反映。由于新的会计处理方法更能反映资金占用、相应风险与收入的配比关系，从而使企业的财务状况核算更加科学。
