此前，对货物和劳务分别征收增值税和营业税，在这种税制结构下增值税纳税人外购劳务所负担的营业税、营业税纳税人外购货物所负担的增值税，均不能抵扣，重复征税问题未能完全消除。

社科院财贸所税收室主任张斌表示，营业税改增值税从整体上来看，能够降低企业负担。

据此前中金公司估算，如果试点扩大到全国，试点行业的税负可能减少约470亿—700亿元。

中金指出，可选择按照营业额的3%缴纳增值税，但不得进行增值税抵扣；因此，没有完整会计账册的小微企业无法享受增值税抵扣带来的税负减轻。

有信息显示，一些企业在营业税改增值税的试点过程中，由于制度和自身业务等因素反而增加了税负。

郑建新表示，从制度层面讲，由于试点仅在部分地区的部分行业开展，试点企业外购的货物和劳务中还有部分不能进行抵扣，所以试点初期个别企业可能会因抵扣不完全，造成企业税收负担短期内会有所增加；从企业层面讲，因为企业成本结构、发展时期、经营策略不同等原因，在改革初期，个别企业税收负担也可能会有一定增加。