根据《国家税务总局关于公路、内河货物运输业统一发票增值税抵扣有关问题的公告》（国家税务总局公告〔2006〕2号）规定，自2007年1月1日起，增值税一般纳税人购进或销售货物，取得的作为增值税扣税凭证的货运发票，必须是通过货运发票税控系统开具的新版货运发票。纳税人取得的2007年1月１日以后开具的旧版货运发票，不再作为增值税扣税凭证抵扣进项税额。纳税人取得的2006年12月31日以前开具的旧版货运发票暂继续作为增值税扣税凭证，纳税人应在开具之日起90天后的第一个纳税申报期结束以前申报抵扣进项税额。自2007年4月1日起，旧版货运发票一律不得作为增值税扣税凭证抵扣进项税额。