2009年4月30日，财政部和国家税务总局联合下发了《关于企业重组业务企业所得税处理若干问题的通知》财税[2009]59号（以下简称“59号文”），该文分别对居民企业与非居民企业重组业务企业所得税的处理，在原来《企业所得税法》及实施条例相关规定的基础上作了更进一步的明确和规范。现笔者对59号文中关于非居民企业跨境重组业务的企业所得税处理解析如下：
一、跨境重组涉及的业务范围
59号文规定企业重组业务指的是企业在日常经营活动以外发生的法律结构或经济结构重大改变的交易，包括企业法律形式改变、债务重组、股权收购、资产收购、合并、分立等。但对于非居民企业，由于其属性的特殊性，即依照外国（地区）法律成立且实际管理机构不在中国境内，但在中国境内设立机构、场所的，或者在中国境内未设立机构、场所，但有来源于中国境内所得的企业。从实质来看，非居民企业的重组业务，最有可能发生的是对来源于中国境内的所控股权或拥有的相应资产进行重组，所以对于非居民企业跨境重组业务的企业所得税处理，也不会涵盖到59号文的所有规定，而最有可能发生的将是因股权收购或资产收购的企业所得税处理。此外，虽然59号文跨境重组业务还有规定“财政部、国家税务总局核准的其他情形”，但从目前实务面来看其他情形还无此先例。

在对非居民企业进行跨境重组业务时，由于考虑到重组中存在境外当事方，国内主管税务机关有时无法进行相应的监督，在税务征管上存在一定的困难，所以59号文在对非居民企业跨境重组业务是否适用特殊性税务处理的规定时，采用从严的征管政策，即其适用的条件将比居民企业更加严格。除满足“特殊重组”的一般条件外，还应该保证被重组企业资产所隐含增值的税收管辖权仍保留在中国境内。具体如下：

⑴具有合理的商业目的，且不以减少、免除或者推迟缴纳税款为主要目的；

⑵被收购、合并或分立部分的资产或股权比例符合本通知规定的比例；

⑶企业重组后的连续12个月内不改变重组资产原来的实质性经营活动；

⑷重组交易对价中涉及股权支付金额符合本通知规定比例；

与《企业所得税法》及实施条例对特别纳税调整规定一样，59号文对企业发生的各项重组业务适用特殊性税务处理，强调应以合理商业目的为前提，这也是税法在防止企业利用重组业务进行避税的一种手段。规定其相关交易需要具有合理的商业目的，且不以减少、免除或者推迟缴纳税款为主要目的。但到目前为止，对“合理商业目的”究竟如何判定，还存在具体政策不够完善，但无论是税务机关、还是企业在判断是否符合“合理商业目的”时，都应注重实质而非形式。