我新近接手一家朋友开的食品批发企业，他的公司从头到我接手换了好几任财务了。我这段时间通过和他交谈，了解了公司现在存在的一些情况：
1、财务软件没有完全使用。
公司用的是管家婆2005+网络版，但是现在只是做为开单用，其他的功能根本没有使用。实际库存与软件库存数量天差地别，软件形同虚设。没有任何数据可以做为公司决策使用。
2、公司经营的产品种类繁杂。
主要经营冷冻食品和常温食品，例如冰淇淋、冻羊肉、火腿肠、卫生纸、酒水等。品种有上百种至上千种（根据以后的发展而定）
3、仓库管理不善。
由于仓库不好招，所以人手有限，仓库员的素质不高。经常出现数量不对，或者是品种不对的现象。
4、财务人员素质不高。
现在的财务人员有3人。一个专门负责开单；另外一个是出纳，年龄40多不太会用电脑；还有一个小女孩基本不懂财务知识。
现在相请教高手我应该怎么进行流程方面的设置和改革？
本人现在想用金蝶商贸版进行管理。